电视剧《南风知我意》改编自七微的小说《南风知我意》第二部。故事涉及四条主要感情线。首先是傅云深和朱旧之间的爱情故事。其次是朱旧与奶奶之间的深厚感情。第三是傅云深与母亲之间的血缘亲情。最后是朱旧作为无国界医生组织志愿者在叙利亚战火下的医疗救援中展现的无畏大爱。这些感情线共同构成了该剧的主要剧情。
《南风知我意》讲述了药物研究员傅云深和外科女医生朱旧之间的爱恨情仇。他们在一次医疗援助中相遇，并共同经历了许多危险。最终，他们找到了一种药用植物，能够制作出特效药，并在这个过程中产生了感情。
然而，傅云深回国后发现同父异母的兄弟傅西洲为了经济利益将药用植物制成了化妆品。傅云深想阻止他，可不幸遭遇车祸，导致受伤严重，只能坐轮椅度过余生。因此，他与朱旧被迫分开。经历了失望、纠结和思念，最终两人重新走到了一起。然而，上一辈的恩怨再次使他们的关系陷入僵局。